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jittor.mpi

计图分布式基于MPIMessage Passing Interface本文档主要阐述使用计图MPI进行多卡和分布式训练的教程。

计图MPI安装

计图依赖OpenMPI,用户可以使用如下命令安装OpenMPI

sudo apt install openmpi-bin openmpi-common libopenmpi-dev

也可以参考 OpenMPI 文档,自行编译安装。

计图会自动检测环境变量中是否包含mpicc,如果计图成功的检测到了mpicc,那么会输出如下信息:

[i 0502 14:09:55.758481 24 __init__.py:203] Found mpicc(1.10.2) at /usr/bin/mpicc

如果计图没有在环境变量中找到mpi用户也可以手动指定mpicc的路径告诉计图添加环境变量即可export mpicc_path=/you/mpicc/path

OpenMPI安装完成以后,用户无需修改代码,需要做的仅仅是修改启动命令行,计图就会用数据并行的方式自动完成并行操作。

# 单卡训练代码
python3.7 -m jittor.test.test_resnet
# 分布式多卡训练代码
mpirun -np 4 python3.7 -m jittor.test.test_resnet
# 指定特定显卡的多卡训练代码
CUDA_VISIBLE_DEVICES="2,3" mpirun -np 2 python3.7 -m jittor.test.test_resnet

这种便捷性的背后是计图的分布式算子的支撑计图支持的mpi算子后端会使用nccl进行进一步的加速。计图所有分布式算法的开发均在Python前端完成这让分布式算法的灵活度增强开发分布式算法的难度也大大降低。

如何从单卡代码适配多卡代码

使用mpirun以下几种模块会自动检测mpi环境并且自动切换成多卡版本

  • jittor.optimizer: 自动同步梯度
  • jittor.nn.BatchNorm* 同步batch norm
  • jittor.dataset 自动数据并行

用户在使用MPI进行分布式训练时计图内部的Dataset类会自动并行分发数据需要注意的是Dataset类中设置的Batch size是所有节点的batch size之和也就是总batch size 不是单个节点接收到的batch size。

大部分情况下,单卡训练的代码可以直接使用mpirun实现分布式多卡运行。 但仍然如下几种情况下,需要对代码进行调整:

  1. 对硬盘进行写操作(保存模型,保存曲线)
  2. 需要统计全局信息validation 上的全局准确率)

对硬盘进行写操作

对于第一点,假设原来您的代码如下:

for i, (images, labels) in enumerate(dataset):
    output = model(images)
    loss = nn.cross_entropy_loss(output, labels)
    acc1 = accuracy(output, labels)
    SGD.step(loss)
    loss_data = loss.data
    writer.add_scalar("Train/loss")

更改后的代码如下:

for i, (images, labels) in enumerate(dataset):
    output = model(images)
    loss = nn.cross_entropy_loss(output, labels)
    acc1 = accuracy(output, labels)
    SGD.step(loss)
    loss_data = loss.data
    if jt.rank == 0:
        writer.add_scalar("Train/loss")

这里我们使用了 jt.rank 来限制,只允许第一个进程可以写 loss这个代码在单卡下也是有效的因为单卡的 jt.rank 值为 0 需要注意的是,在 if jt.rank == 0 代码块里面的代码不允许调用任何jittor的api因为这很有可能导致多卡之间的api调用不一致而产生死锁!

需要统计全局信息

统计全局信息有两种方法,第一种是使用提供的 mpi op 来实现全局信息统计, 如下所示, 是一个validation的代码

def val(epoch):
    global min_error
    model.eval()
    correct_nums = 0
    for i, (images, labels) in enumerate(valdataset):
        output = model(images)
        correct_nums += top1error(output, labels)
        correct_nums.sync()
    top1_error = (valdataset.total_len - correct_nums.data[0]) / valdataset.total_len
    if top1_error < min_error:
        print("[*] Best model is updated ...")
        model.save('model_best.pkl')

更改方案如下:

def val(epoch):
    global min_error
    model.eval()
    correct_nums = 0
    for i, (images, labels) in enumerate(valdataset):
        output = model(images)
        correct_nums += top1error(output, labels)
        correct_nums.sync()
    if jt.in_mpi:
        correct_nums = correct_nums.mpi_all_reduce()
    top1_error = (valdataset.total_len - correct_nums.data[0]) / valdataset.total_len
    if jt.rank == 0 and top1_error < min_error:
        print("[*] Best model is updated ...")
        model.save('model_best.pkl')

可以留意到我们首先使用了 mpi_all_reduce 来统计多卡的正确数量(mpi_all_reduce会将多个mpi进程的结果累加起来) 然后在 jt.rank == 0 的情况下才更新模型。

第二种方法是使用@jt.single_process_scope(),被装饰的代码会直接以单进程的方式执行,无需处理多卡。

@jt.single_process_scope()
def val(epoch):
    ......

MPI接口

下面是 jittor 的 mpi api reference. 目前MPI开放接口如下

  • jt.in_mpi: 当计图不在MPI环境下时jt.mpi == False 用户可以用这个判断是否在mpi环境下。
  • jt.world_size: 获取当前进程总数量如果没有用mpi则为1。
  • jt.rank: 获取当前进程的编号,区间为0 jt.world_size-1 如果没有用mpi则为0。
  • jt.mpi: 计图的MPI模块。
  • jt.Module.mpi_param_broadcast(root=0): 将模块的参数从root节点广播给其他节点。
  • jt.mpi.mpi_reduce(x, op='add', root=0): 将所有节点的变量x使用算子opreduce到root节点。如果op是'add'或者'sum'该接口会把所有变量求和如果op是'mean',该接口会取均值。
  • jt.mpi.mpi_broadcast(x, root=0): 将变量x从root节点广播到所有节点。
  • jt.mpi.mpi_all_reduce(x, op='add'): 将所有节点的变量x使用一起reduce并且吧reduce的结果再次广播到所有节点。如果op是'add'或者'sum'该接口会把所有变量求和如果op是'mean',该接口会取均值。
.. automodule:: jittor_mpi_core
   :members:
   :undoc-members:
.. automodule:: jittor_mpi_core.ops
   :members:
   :undoc-members:

实例MPI实现分布式同步批归一化层

下面的代码是使用计图实现分布式同步批归一化层的实例代码在原来批归一化层的基础上只需增加三行代码就可以实现分布式的batch norm添加的代码如下

# 将均值和方差通过all reduce同步到所有节点
if self.sync and jt.mpi:
    xmean = xmean.mpi_all_reduce("mean")
    x2mean = x2mean.mpi_all_reduce("mean")

注:计图内部已经实现了同步的批归一化层,用户不需要自己实现

分布式同步批归一化层的完整代码:

class BatchNorm(Module):
    def __init__(self, num_features, eps=1e-5, momentum=0.1, affine=None, is_train=True, sync=True):
        assert affine == None

        self.sync = sync
        self.num_features = num_features
        self.is_train = is_train
        self.eps = eps
        self.momentum = momentum
        self.weight = init.constant((num_features,), "float32", 1.0)
        self.bias = init.constant((num_features,), "float32", 0.0)
        self.running_mean = init.constant((num_features,), "float32", 0.0).stop_grad()
        self.running_var = init.constant((num_features,), "float32", 1.0).stop_grad()

    def execute(self, x):
        if self.is_train:
            xmean = jt.mean(x, dims=[0,2,3], keepdims=1)
            x2mean = jt.mean(x*x, dims=[0,2,3], keepdims=1)
            # 将均值和方差通过all reduce同步到所有节点
            if self.sync and jt.mpi:
                xmean = xmean.mpi_all_reduce("mean")
                x2mean = x2mean.mpi_all_reduce("mean")

            xvar = x2mean-xmean*xmean
            norm_x = (x-xmean)/jt.sqrt(xvar+self.eps)
            self.running_mean += (xmean.sum([0,2,3])-self.running_mean)*self.momentum
            self.running_var += (xvar.sum([0,2,3])-self.running_var)*self.momentum
        else:
            running_mean = self.running_mean.broadcast(x, [0,2,3])
            running_var = self.running_var.broadcast(x, [0,2,3])
            norm_x = (x-running_mean)/jt.sqrt(running_var+self.eps)
        w = self.weight.broadcast(x, [0,2,3])
        b = self.bias.broadcast(x, [0,2,3])
        return norm_x * w + b